Bacteriocinas

As bacteriocinas são categorizadas de várias maneiras, incluindo a produção de cepas, mecanismos comuns de resistência e mecanismo de morte. Existem várias grandes categorias de bacteriocinas que são apenas fenomenologicamente relacionadas. Estas incluem as bacteriocinas de bactérias gram-positivas, as colicinas, os microcins e as bacteriocinas de Archaeas. As bacteriocinas de E. coli são chamadas de colicinas. São as bacteriocinas mais estudadas. Eles são um grupo diverso de bacteriocinas e não incluem todas as bacteriocinas produzidas pela E. coli. De fato, uma das mais antigos conhecidas, chamadas colicinas, foi a colicina V , e é agora conhecido como microcin V . É muito menor e produzido e segregado de uma maneira diferente das clássicas colicinas. Esse sistema de nomenclatura é problemático por vários motivos. Primeiro, nomear bacteriocinas pelo que elas supostamente matam seria mais preciso se o seu espectro mortal fosse próximo de designações de gênero ou espécie. As bacteriocinas frequentemente possuem espectros que excedem os limites de sua taxinomia e quase nunca matam a maioria das especies para os quais são nomeados para (provavelmente pela coevolução). Além disso, a nomenclatura original é geralmente derivada não da linhagem sensível que a bacteriocina mata, mas sim do organismo que produz a bacteriocina. Isso faz com que o uso desse sistema de nomenclatura seja uma base problemática para a teoria; assim, os sistemas de classificação alternativos.