ChEMBL
ChEMBL ou ChEMBLdb é uma base de dados química revista manualmente de moléculas bioactivas com propriedades de fármaco. É mantida pelo Instituto Europeu de Bioinformática, do Laboratório de Biologia Molecular Europeu, com sede no Wellcome Trust Genome Campus, em Hinxton, Reino Unido.
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A base de dados ChEMBL contém dados de bioactividade de compostos contra dianas de drogas. A bioactividade informa-se em Ki, Kd, IC50, e EC50. Os dados podem ser filtrados e analisados para desenvolver libarias de crivado (screening) de compostos para a identificação durante a descoberta de fármacos. ChEMBL versão 2 (ChEMBL_02) lançada em janeiro de 2010, e incluía 2,4 milhões de medidas de bioensaios que abrangiam 622.824 compostos, incluindo 24.000 de produtos naturais. Isto obteve da revisão de 34.000 publicações de doze revistas de química medicinal. A cobertura de ChEMBL dos dados de bioatividade disponível foi medrando até converter-se na "mais completa vista numa base de dados pública.". Em outubro de 2010 saiu ChEMBL versão 8 (ChEMBL_08), com umas 2,97 milhões de medidas de bioensaios que abrangem 636.269 compostos. O ChEMBL_10 acrescentou os ensaios confirmatórios da PubChem, para integrar dados que são comparáveis com o tipo e classe de dados contidos em ChEMBL.
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Ademais das bases de dados, o grupo ChEMBL desenvolveu ferramentas e recursos para a mineração de dados. Estes incluem Kinase SARfari, um banco de trabalho (workbench) de quimioxenómica integrado enfocado às quinases. O sistema incorpora uma sequência de ligações, estrutura, compostos e dados de crivado (screening). GPCR SARfari é um workbench similar centrado nos GPCRs, e ChEMBL-NTD (ChEMBL-Neglected Tropical Diseases) é um depósito de dados de crivado primário e química medicinal de acesso aberto dirigido a doenças tropicais endémicas de regiões subdesenvolvidas da África, Ásia, e as Américas. O propósito principal de ChEMBL-NTD é proporcionar ficheiros permanentes e livremente acessíveis e um centro de distribuição para os dados depositados. Em julho de 2012 saiu um novo serviço de dados da malária, patrocinado por Medicines for Malaria Venture (MMV), dirigido a investigadores de todo mundo. Os dados deste serviço incluem compostos do conjunto de crivado Malaria Box, e também os outros dados sobre a malária singelos que se encontram em ChEMBL-NTD.


